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Participer au projet BOINC/

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Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Jeu 5 Juin - 19:51

Je mes suis lancé, biene que la machine ne soit pas une Rolls et même soit assez limitée et que je dépende de la puissance de la connexion allouée d'ou je squatte la spot wifi, au projet de la SIMAP, un calcul sous forme de cluster international, destiné à résoudre les similitudes entre les protéïnes : http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/

Bien des explications se trouvent au : http://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/IntroUser et tant que je peux faire quelque chose afin de faire progresser et utiliser ma bécane, en LL et participer à un cluster mondial, basé sur des serveurs qui sont eux aussi sur du .nix ou .nux, je le fait:)!

Ce projet déborde un peu de la page et est autant liée au projet wikinenveut, sur le linux et les pages web, que destiné à demeurer ici, mais fait quand-même parti de wikinenfait, parce que je fais ainsi quelque chose:)!

Je cross-poste entre les deux pages, si ça ne pose pas de problèmes de plantages, et parce que ça fait suite à l'article au : http://wikienveut.forumsactifs.net/wikienveut-f4/ma-passion-linux-t4-30.html entre autre:)!


--
apt-get wikifait des trucs:)!
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Ven 6 Juin - 11:49

Et tout, tout, tout, vous saurez tout sur Linux Smile, au : http://en.wikipedia.org/wiki/Linux et là entre autre...Smile!
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Ven 6 Juin - 11:58

Le problème est ensuite un gros problème de paramétrage, vu qu'il y a plusieures version du moteur et que je suis sur une machine paramétrée en 386 et non 686...Sad! Euh, attendre de tout remonter afin d'optimiser celle-ci, puis réinstaller le projet et ses dépendances et .app:)?

C ce que l'on me dit au : http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/alternative_boinc_attachment_procedures.html Smile!

'Alternative BOINC attachment procedures




Due a bug in the BOINC client 4.5 to 5.2.15, which deletes the contents in the project/$PROJECTNAME directory is a alternative attachment projecedure needed.
This bug was fixed in the boinc client 5.4.9. But these alternative attachment projecdures also guilty for the new BOINC clients.



1. Automaticly attach via the configure script


You can use the configure script, which ask you for a BOINC user and a group, attaches automaticly to the project and set all the filepermitions right.

The output from a sample run :

BOINC configure for the project boincsimap


Please enter the your boinc directory : /opt/boinc


Please specify the account key, you got mailed from the
project boincsimap (boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap)

Account key : $ENTER_YOUR_ACCOUNT_KEY_YOU_HAVE_GOT_MAILED_FROM_THE_PROJECT

Please let boinc run with a seperate boinc user and group.
It is recommended. If you have already a seperate boinc user, you
have got to specify it, too...


Add a user and group for BOINC ? [y|n] ? y

Username : boinc

Group name : boinc

Selected BOINC directory : /opt/boinc
Selected User : boinc
Selected Group ID : boinc
Add and new user for BOINC : y

Please stop your boinc client if it is running in the moment !

Should we start now the installation [y/n] ? y

Adding User : boinc and group : boinc


Attaching to the project ...

Copy the boincsimap files and set the permitions...


Configuration finished....

Now you can su to your BOINC user 'su - boinc' and start the BOINC
client with the command './boinc_client'




2. Manualy attach with the BOINC manager or BOINC client



2.1 BOINC manager with using the password


With these steps you can attach using the boinc manager to attach to the project :
- start the BOINC manager
- select Projects / Attach to project within the BOINC manager and enter all the needed values
- stop the BOINC client
- Make now a subdirectory under your BOINC directory :
mkdir $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap
- Copy the needed files to the project directory and set the owner and permitions
cp simap-5.* $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de_boincsimap
cp app_info.xml $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de_boincsimap
chown -R $BOINCUSER:$BOINCGROUP $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de_boincsimap
chmod 750 $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap
chmod 550 $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/simap-5*
- Start the boinc client again :
(su - $BOINCUSER)
./boinc_client -update_project http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap

Now the boinc client detects the new project and will download new work.



2.2 BOINC client with using the account key


You can also attach with the BOINC manager or BOINC client to the project :

- stop the BOINC client
- start the BOINC client with the "-attach_project" option :
boinc_client -attach_project http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap
- Make now a subdirectory under your BOINC directory :
mkdir $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap
- Copy the needed files to the project directory and set the owner and permitions
cp simap-5.* $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de_boincsimap
cp app_info.xml $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de_boincsimap
chown -R $BOINCUSER:$BOINCGROUP $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de_boincsimap
chmod 750 $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap
chmod 550 $BOINCDIR/project/boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/simap-5*
- Start the boinc client again :
(su - $BOINCUSER)
./boinc_client -update_project http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap

Now the boinc client detects the new project and will download new work.

.. et encore je résume...Smile!
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Ven 6 Juin - 12:12

Tout, out ce qu'il faut savoir et faire est au : http://wiki.debian.org/BOINC#head-a2a2abbce095618c1433ce368aa2dbdae1df2515 et cette fois il y a les explications..., mais je ne suis pas sudower sur ce profil, aussi je fini mes téléchargements et je me logue sur l'autre profil, qui est celui de l'admin 'sudowé' et fait pour ça, pour des raisons de sécurités:)!

Bon cette fois-ci j'ai repris les affaires sur une autre machine-x et avec la clé : 1024

c4d48...... 0001
.
Et sinon un peu de ce qui m'intéresse est aussi au : http://www.ssl.berkeley.edu/research/index.php ; et d'ailleurs aussi traîté par et sur la pages de :

http://wikienveut.forumsactifs.net/wikinenfait-f3/nux-et-quelques-questions-importantes-t28.html


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apt-get il va y arriver, si, si:)!
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Sam 29 Nov - 21:12

http://boinc.berkeley.edu/download.php et http://www.polytechnique.fr/ pour le http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/ Smile?
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Sam 29 Nov - 21:58

Au moins lire un peu de doc sur les différents projets Smile?

http://www.isgtw.org/?pid=10001&tagID=10021 , http://www.gpugrid.net/learn.php , et parfois tomber sur des sujets à être collé par-terre, comme :

http://sc08.supercomputing.org/ sur la convention des super ordinateurs:)!
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Mar 14 Avr - 20:30

Et ce qui se fait sur la page de site de conseils linux : http://www.guidelinux.org/phpBB/

à propos de la liste french de BOINC

http://www.mappemonde.net/carte/AF_BOINC/monde.html


Le monde est petit

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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Jeu 28 Mai - 17:20



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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Ven 29 Mai - 11:38

En fait le but est de mettre des machines en prod', afin d'offrir à la communauté des scientifique du temps de calcul, par internet sur divers projets, et ce de façon 'mutualisé'Smile!
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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Ven 29 Mai - 18:18

Si j'ai pas eut le temps de monter une équipe, je fait déjà ça de diverses machines:)!

http://setiathome.berkeley.edu/hosts_user.php?userid=8888032

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Re: Participer au projet BOINC/

Message  Mimi le Lun 1 Juin - 13:06

Du lourd du point de vue doc au :/wiki BOINC Smile!


http://boinc.berkeley.edu/wiki/Main_Page
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